A área de pesquisa no Centro é coordenada por um Departamento específico reponsavel pelo seguinte:

• Elaborar propostas de projectos de investigação e submeter ao Conselho Técnico-Científico para aprovação;
• Assegurar a execução de projectos de pesquisa da História da Luta de Libertação Nacional, dos factos históricos da Defesa da Soberania e da Democracia; 
• Divulgar os projectos de pesquisa da História da Luta de Libertação Nacional, dos factos históricos da Defesa da Soberania e da Democracia;
• Coordenar a edição de livros, brochuras revistas e demais documentos que relatem a história da Luta de Libertação Nacional, dos factos históricos da Defesa da Soberania e da Democracia;
• Promover exposições, seminários e workshops para o debate de matérias relacionadas com a História da Luta de Libertação Nacional, factos históricos da Defesa da Soberania e da Democracia em Moçambique, na região e em África no Geral;
• Realizar a pesquisa bibliográfica e documental e outras obras de referência sobre assuntos ligados a História da Luta de Libertação Nacional, dos factos Históricos da Defesa da Soberania e da Democracia;
• Realizar a pesquisa e recolha de registos fotográficos e documentais inerentes a História da Luta de Libertação Nacional, dos factos históricos da Defesa da Independência, Soberania e da Democracia com vista a criação do Banco de Dados do IPHLLN e para o apetrechamento da biblioteca para à consulta pública.
• Elaborar o balanço anual de Investigação Científica do IPHLLN a ser apresentado no Conselho Científico.